Институт экономической политики имени Е.Т. Гайдара активно участвует в интеграции научной и образовательной сфер, подготовке научно-педагогических кадров высшей квалификации.

С 1998 года в Институте открыта Аспирантура по направлению 38.06.01 Экономика (научная специальность 08.00.01 Экономическая теория).

С 1998 г. Институт Гайдара реализует программу по подготовке нового поколения экономистов совместно с Высшей школой экономики и Российской экономической школой на базе Московского физико-технического института.

С 2005 г. реализуется программа высшего профессионального образования (бакалавриат и магистратура) совместно с РАНХиГС при Президенте России, Московским физико-техническим институтом и Российской экономической школой. По окончании программы студенты одновременно получают государственные дипломы по экономической и технической специальностям. Финансовую помощь в реализации этой образовательной программы оказывают Морган Стэнли Банк и Сбербанк России.

Издательством Института Гайдара издаются учебники и учебные пособия в тех сферах, где особенно ощущается их дефицит: микро- и макроэкономика, эконометрика, экономика общественного сектора, институциональная теория и др.

В Институте Гайдара проходят стажировку студенты, аспиранты, молодые ученые из российских и зарубежных исследовательских центров. Институт Гайдара проводит ежегодный Конкурс на лучшую выпускную квалификационную работу по экономике. В конкурсе могут принять участие выпускники экономических ВУЗов и экономических факультетов высших учебных заведений России